MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016112	CAA	2	6	213724	213729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403578
4002	NC_016112	GCCA	2	8	213805	213812	25 %	0 %	25 %	50 %	357403578
4003	NC_016112	AATA	2	8	213865	213872	75 %	25 %	0 %	0 %	357403578
4004	NC_016112	TG	3	6	213978	213983	0 %	50 %	50 %	0 %	357403578
4005	NC_016112	CAT	2	6	214015	214020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403578
4006	NC_016112	CTG	2	6	214072	214077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403578
4007	NC_016112	CGG	2	6	214085	214090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403578
4008	NC_016112	TTG	2	6	214111	214116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403578
4009	NC_016112	CAG	2	6	214189	214194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403578
4010	NC_016112	GGC	2	6	214280	214285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403578
4011	NC_016112	GAC	2	6	214303	214308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403578
4012	NC_016112	GCC	2	6	214326	214331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403578
4013	NC_016112	GCC	2	6	214348	214353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403578
4014	NC_016112	CAAG	2	8	214356	214363	50 %	0 %	25 %	25 %	357403578
4015	NC_016112	GA	3	6	214415	214420	50 %	0 %	50 %	0 %	357403578
4016	NC_016112	GCCAT	2	10	214421	214430	20 %	20 %	20 %	40 %	357403578
4017	NC_016112	CTTG	2	8	214498	214505	0 %	50 %	25 %	25 %	357403579
4018	NC_016112	TGAACA	2	12	214558	214569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	357403579
4019	NC_016112	ACC	2	6	214664	214669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403579
4020	NC_016112	CATCGG	2	12	214774	214785	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357403579
4021	NC_016112	CAAC	2	8	214891	214898	50 %	0 %	0 %	50 %	357403579
4022	NC_016112	ATC	2	6	214919	214924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403579
4023	NC_016112	AACA	2	8	214949	214956	75 %	0 %	0 %	25 %	357403579
4024	NC_016112	TCA	2	6	214980	214985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403579
4025	NC_016112	ACC	2	6	215018	215023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403579
4026	NC_016112	T	6	6	215051	215056	0 %	100 %	0 %	0 %	357403579
4027	NC_016112	TCG	2	6	215082	215087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403579
4028	NC_016112	CAT	2	6	215092	215097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403579
4029	NC_016112	CAT	2	6	215099	215104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403579
4030	NC_016112	CA	3	6	215106	215111	50 %	0 %	0 %	50 %	357403579
4031	NC_016112	TCAAA	2	10	215142	215151	60 %	20 %	0 %	20 %	357403579
4032	NC_016112	GCA	2	6	215288	215293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_016112	AGA	2	6	215299	215304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016112	ACA	2	6	215305	215310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_016112	GCG	2	6	215394	215399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_016112	CAC	2	6	215487	215492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_016112	GCT	2	6	215594	215599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_016112	ATT	2	6	215622	215627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016112	CCA	2	6	215693	215698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_016112	A	6	6	215729	215734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016112	A	6	6	215738	215743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016112	A	6	6	215747	215752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016112	A	6	6	215756	215761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016112	TTA	2	6	215776	215781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016112	T	6	6	215797	215802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016112	A	6	6	215906	215911	100 %	0 %	0 %	0 %	357403580
4047	NC_016112	GCTT	2	8	216034	216041	0 %	50 %	25 %	25 %	357403580
4048	NC_016112	TGTAA	2	10	216097	216106	40 %	40 %	20 %	0 %	357403580
4049	NC_016112	CTT	2	6	216147	216152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403581
4050	NC_016112	GGC	2	6	216307	216312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403581
4051	NC_016112	TGT	2	6	216332	216337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403581
4052	NC_016112	TCC	2	6	216374	216379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_016112	ACA	2	6	216415	216420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_016112	TGT	2	6	216439	216444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016112	TC	3	6	216454	216459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_016112	T	6	6	216471	216476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016112	CTT	2	6	216509	216514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403582
4058	NC_016112	GCT	2	6	216559	216564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403582
4059	NC_016112	ATT	2	6	216621	216626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403582
4060	NC_016112	GGCC	2	8	216718	216725	0 %	0 %	50 %	50 %	357403582
4061	NC_016112	T	7	7	216729	216735	0 %	100 %	0 %	0 %	357403582
4062	NC_016112	AAT	2	6	216746	216751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403582
4063	NC_016112	CGGA	2	8	216825	216832	25 %	0 %	50 %	25 %	357403582
4064	NC_016112	T	7	7	216859	216865	0 %	100 %	0 %	0 %	357403582
4065	NC_016112	GTC	2	6	216921	216926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403582
4066	NC_016112	TC	3	6	216953	216958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_016112	T	6	6	217045	217050	0 %	100 %	0 %	0 %	357403583
4068	NC_016112	AGT	2	6	217062	217067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403583
4069	NC_016112	AGC	2	6	217138	217143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4070	NC_016112	GCC	2	6	217184	217189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403583
4071	NC_016112	CTT	2	6	217252	217257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403583
4072	NC_016112	CCG	3	9	217266	217274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403583
4073	NC_016112	ATG	2	6	217514	217519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403583
4074	NC_016112	AAAC	2	8	217544	217551	75 %	0 %	0 %	25 %	357403583
4075	NC_016112	TCC	2	6	217557	217562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403583
4076	NC_016112	GTA	2	6	217588	217593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403583
4077	NC_016112	T	7	7	217617	217623	0 %	100 %	0 %	0 %	357403583
4078	NC_016112	TGAAT	2	10	217708	217717	40 %	40 %	20 %	0 %	357403583
4079	NC_016112	CGG	2	6	217804	217809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403583
4080	NC_016112	GCT	2	6	217881	217886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4081	NC_016112	GTC	2	6	218087	218092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4082	NC_016112	TCGC	2	8	218236	218243	0 %	25 %	25 %	50 %	357403583
4083	NC_016112	AATC	2	8	218260	218267	50 %	25 %	0 %	25 %	357403583
4084	NC_016112	CAAA	2	8	218314	218321	75 %	0 %	0 %	25 %	357403583
4085	NC_016112	A	6	6	218319	218324	100 %	0 %	0 %	0 %	357403583
4086	NC_016112	GCC	2	6	218325	218330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403583
4087	NC_016112	GGC	2	6	218396	218401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403583
4088	NC_016112	TTG	2	6	218484	218489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403583
4089	NC_016112	TTG	2	6	218555	218560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403583
4090	NC_016112	GGT	2	6	218588	218593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403583
4091	NC_016112	CGG	2	6	218660	218665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403583
4092	NC_016112	TCG	2	6	218679	218684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4093	NC_016112	AAAG	2	8	218812	218819	75 %	0 %	25 %	0 %	357403583
4094	NC_016112	TTC	2	6	218834	218839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403583
4095	NC_016112	TTTGAA	2	12	218915	218926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	357403583
4096	NC_016112	GCA	2	6	218995	219000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4097	NC_016112	TCG	2	6	219015	219020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4098	NC_016112	GAT	2	6	219092	219097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403583
4099	NC_016112	GCT	2	6	219180	219185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4100	NC_016112	ATC	2	6	219261	219266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403583
4101	NC_016112	TACCGG	2	12	219277	219288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4102	NC_016112	TCG	2	6	219315	219320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4103	NC_016112	GGCGC	2	10	219329	219338	0 %	0 %	60 %	40 %	357403583
4104	NC_016112	CGT	2	6	219367	219372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4105	NC_016112	TTCA	2	8	219416	219423	25 %	50 %	0 %	25 %	357403583
4106	NC_016112	CGT	2	6	219436	219441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4107	NC_016112	GC	3	6	219608	219613	0 %	0 %	50 %	50 %	357403583
4108	NC_016112	TGC	2	6	219684	219689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403583
4109	NC_016112	T	6	6	219716	219721	0 %	100 %	0 %	0 %	357403583
4110	NC_016112	GCC	2	6	219728	219733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403583
4111	NC_016112	AAT	2	6	219912	219917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403583
4112	NC_016112	ATG	2	6	219946	219951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403583
4113	NC_016112	CGA	2	6	220006	220011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403584
4114	NC_016112	ATG	2	6	220047	220052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403584
4115	NC_016112	AGC	2	6	220179	220184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403584
4116	NC_016112	ATA	2	6	220275	220280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016112	CCT	2	6	220376	220381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_016112	TTC	2	6	220472	220477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_016112	CTCG	3	12	220659	220670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_016112	TCTT	2	8	220676	220683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_016112	GAT	2	6	220875	220880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016112	TCT	2	6	221045	221050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403585
4123	NC_016112	AAC	2	6	221077	221082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403585
4124	NC_016112	TGA	2	6	221112	221117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403585
4125	NC_016112	A	6	6	221158	221163	100 %	0 %	0 %	0 %	357403585
4126	NC_016112	TTC	2	6	221171	221176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403585
4127	NC_016112	A	7	7	221186	221192	100 %	0 %	0 %	0 %	357403585
4128	NC_016112	TCA	2	6	221223	221228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403585
4129	NC_016112	CGA	2	6	221271	221276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403585
4130	NC_016112	TTC	2	6	221306	221311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403585
4131	NC_016112	ATG	2	6	221319	221324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403585
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4133	NC_016112	TAA	2	6	221383	221388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403585
4134	NC_016112	TTA	2	6	221402	221407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403586
4135	NC_016112	A	6	6	221413	221418	100 %	0 %	0 %	0 %	357403586
4136	NC_016112	T	8	8	221446	221453	0 %	100 %	0 %	0 %	357403586
4137	NC_016112	TCC	2	6	221488	221493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403586
4138	NC_016112	CTG	2	6	221494	221499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403586
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4142	NC_016112	TTC	2	6	221607	221612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403586
4143	NC_016112	TTC	2	6	221625	221630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403586
4144	NC_016112	ATG	2	6	221650	221655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403586
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4146	NC_016112	TAAA	2	8	221756	221763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_016112	T	6	6	221800	221805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_016112	CG	3	6	221882	221887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4149	NC_016112	A	6	6	221913	221918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_016112	ACA	2	6	222073	222078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4151	NC_016112	TGT	2	6	222181	222186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403587
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4153	NC_016112	TTTA	2	8	222197	222204	25 %	75 %	0 %	0 %	357403587
4154	NC_016112	ATTT	2	8	222222	222229	25 %	75 %	0 %	0 %	357403587
4155	NC_016112	CAA	2	6	222255	222260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403587
4156	NC_016112	GTTG	2	8	222263	222270	0 %	50 %	50 %	0 %	357403587
4157	NC_016112	AG	3	6	222337	222342	50 %	0 %	50 %	0 %	357403587
4158	NC_016112	TTA	2	6	222401	222406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403587
4159	NC_016112	TTG	2	6	222442	222447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403587
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4177	NC_016112	GAGTT	2	10	223592	223601	20 %	40 %	40 %	0 %	357403588
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4181	NC_016112	TAA	2	6	223755	223760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4182	NC_016112	AAC	2	6	223785	223790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4183	NC_016112	A	7	7	223814	223820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4184	NC_016112	TAA	2	6	223873	223878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_016112	A	6	6	226090	226095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_016112	CAG	2	6	226175	226180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4232	NC_016112	TTG	2	6	226274	226279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_016112	ACA	2	6	226304	226309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4234	NC_016112	CCAT	2	8	226410	226417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4235	NC_016112	CGC	2	6	226428	226433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4236	NC_016112	CAA	2	6	226490	226495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4237	NC_016112	ATT	2	6	226514	226519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_016112	CGGCT	2	10	226572	226581	0 %	20 %	40 %	40 %	357403590
4239	NC_016112	AAT	2	6	226604	226609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403590
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4241	NC_016112	GTA	2	6	226646	226651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403590
4242	NC_016112	GAT	2	6	226652	226657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403590
4243	NC_016112	CGG	2	6	226673	226678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403590
4244	NC_016112	CCT	2	6	226679	226684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403590
4245	NC_016112	GAA	2	6	226701	226706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403590
4246	NC_016112	TGA	2	6	226730	226735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403590
4247	NC_016112	TGG	2	6	226830	226835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_016112	A	6	6	226839	226844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_016112	T	6	6	226853	226858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_016112	TTAAG	2	10	226900	226909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_016112	GAG	2	6	226970	226975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_016112	CCG	2	6	227194	227199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4253	NC_016112	TCC	2	6	227247	227252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4254	NC_016112	TTC	2	6	227265	227270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_016112	T	6	6	227501	227506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4353	NC_016112	T	6	6	233742	233747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4354	NC_016112	A	7	7	233786	233792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4376	NC_016112	GAT	2	6	235061	235066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403598
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4383	NC_016112	GAA	3	9	235359	235367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_016112	AAG	2	6	235369	235374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4481	NC_016112	TCG	2	6	240029	240034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403601
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4485	NC_016112	CAA	2	6	240262	240267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403601
4486	NC_016112	T	6	6	240307	240312	0 %	100 %	0 %	0 %	357403601
4487	NC_016112	GGC	2	6	240347	240352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403601
4488	NC_016112	ATG	2	6	240373	240378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403601
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4490	NC_016112	ACCA	2	8	240548	240555	50 %	0 %	0 %	50 %	357403601
4491	NC_016112	CGTC	2	8	240557	240564	0 %	25 %	25 %	50 %	357403601
4492	NC_016112	GATC	2	8	240615	240622	25 %	25 %	25 %	25 %	357403601
4493	NC_016112	TTG	2	6	240656	240661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403601
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4495	NC_016112	AG	3	6	240813	240818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_016112	TAAG	2	8	240824	240831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_016112	TTA	2	6	240869	240874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_016112	TTGA	2	8	240898	240905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_016112	TGCA	2	8	240930	240937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4500	NC_016112	TTA	2	6	240965	240970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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